Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MLIPQ5VWP3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms