Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD1Q5SYB0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms