Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIST3H3Q16695 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms