Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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