Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
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