Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FAT1Q14517 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms