Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
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