Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms