Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms