Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms