Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms