Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
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