Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms