Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms