Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms