Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
XIRP2A4UGR9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XIRP2A4UGR9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XIRP2A4UGR9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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