Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBE1Q9UJT0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms