Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms