Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms