Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms