Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATA5Q9BWX5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms