Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms