Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms