Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms