Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBP4Q96PP9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms