Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms