Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms