Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms