Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HECW1Q76N89 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms