Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms