Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms