Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms