Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms