Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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