Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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