Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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