Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP1Q13363 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms