Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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