Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms