Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms