Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms