Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms