Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRMP28827 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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