Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YY1P25490 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YY1P25490 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YY1P25490 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YY1P25490 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YY1P25490 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms