Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GADD45AP24522 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GADD45AP24522 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms