Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms