Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gria3Q9Z2W9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gria3Q9Z2W9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria3Q9Z2W9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gria3Q9Z2W9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms