Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sh3bp5Q9Z131 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh3bp5Q9Z131 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp5Q9Z131 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sh3bp5Q9Z131 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms