Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4fQ9Z123 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4fQ9Z123 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms