Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mixl1Q9WUI0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mixl1Q9WUI0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mixl1Q9WUI0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms